Prof. Dr. Netz:
Simulationen und Multiskalenmodellierung von multivalenten Zucker-Protein-Wechselwirkungen

Wechselwirkungen zwischen Proteinen und zuckerartigen Verbindungen sind essentiell für eine ganze Reihe von biologischen, medizinischen und technologischen Fragestellungen. Die Arbeitsgruppe Netz wird exemplarisch die multivalente Bindung zwischen dem viralen Membranprotein Hämagglutinin und dem zellulären Liganden Sialinsäure in einem Multiskalenansatz  untersuchen. Dazu wird zuerst die Hämagglutinin-Sialinsäure Bindungslandschaft mit atomistischen MD Simulationen ermittelt. Zusammen mit der Dehnungs-Kraft-Relationen für ein Linkerpolymer wird dann die multivalente Freie Energie der multivalenten Bindung rekonstruiert. Optimale Länge, Geometrie und Steifigkeit des Linkerpolymers folgt durch Minimierung der globalen Freien Energielandschaft.

 

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Fachbereich Physik  
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